1.《心路历程》，台北：文星书店，1964；台北：传记文学社，1979。
2.《中国上古史论文选辑》，台北：国风出版社，1965；台北：台联国风，1966、1975。
3.《历史学研究》，台北：台湾商务印书馆，1966。
4.《传统与更新》，台北：中央研究院三民主义研究所，1980。
5.《求古编》，台北：联经出版事业公司，1982。

6.《关心集》，台北：时报文化出版企业公司，1982。
7.《第二届中国社会经济史研讨会论文集》（与毛汉光、刘翠溶主编），台北：汉学研究资料及服务中心丛刊，1983。
8.《西周史》，台北：联经出版事业公司，1984；北京：三联书店，1994；修订三版，台北：联经出版事业公司，1990。
9.《中国何处去？》（钱穆、余英时、许倬云等着），台北：联合月刊，1986。
10.《知识与民主》（与他人合着），台北：幼狮文化，1986。

11.《劳贞一先生八秩荣庆论文集》（与他人合着），台北：台湾商务印书馆，1986。
12.《中国历史论文集》（与他人合着），台北：台湾商务印书馆，1986。
13.《抗战胜利的代价：抗战胜利四十周年学术论文集》（与丘宏达主编），台北：联经出版事业公司，1986。
14.《中国古代文化的特质》，台北：联经出版事业公司，1988。
15.《挑战与更新：许倬云文集（政论之册）》，台北：时报文化出版企业公司，1988。

16.《刹那与永恒：许倬云文集（文化之册）》，台北：时报文化出版企业公司，1988。
17.《中华民国文化发展之评估与展望》（与他人合着），台北：行政院文化建设委员会，1990。
18.《推动历史的因素》，台北：社会大学文教基金会，1990。
19.《站在历史的转折点上——李登辉先生政策理念之探析》（与他人合着），台北：正中书局，1990。
20.《中国文化与世界文化》，贵阳：贵州人民出版社，1991。

21.《风雨江山：许倬云的天下事》，台北：天下文化，1991。
22.《中国文化的发展过程》，香港：香港中文大学出版社，1992。
23.《从历史看领导》，台北：洪建全教育文化基金会，1992；北京：三联书店，1994。
24.《寻找90年代的人生价值》（与他人合着），台北：洪建全教育文化基金会，1994。
25.《现代伦理寓言——东游记》，台北：洪建全教育文化基金会，1995。

26.《现代社会的职业伦理》，台北：洪建全教育文化基金会，1995。
27.《寻路集》，River Edge, New Jersey：八方文化企业公司，1996。
28.《现代社会的公平与正义》，台北：洪健全教育文化基金会，1996。
29.《从历史看组织》，台北：洪建全教育文化基金会，1997。

30.《汉代农业：早期中国农业经济的形成》（程农、张鸣译），南京：江苏人民出版社，1998。
31.《历史分光镜》，上海：上海文艺出版社，1998。
32.《九六文录：中国人文探索》，台北：台湾书店，1998。
33.《中国考古学的跨世纪反思》（与张忠培主编），香港：商务印书馆，1999。
34.《系统视野与宇宙人生》（与陈天机、关子尹主编），香港：商务印书馆，1999。